Fakulteta za državne in evropske študije ima naslednje katedre:
- Katedro za ustavno pravo in človekove pravice
Predstojnik katedre: prof. dr. Peter Jambrek - Katedro za javno upravo
Predstojnik katedre: prof. dr. Tone Jerovšek - Katedro za mednarodne, evropske in diplomatske študije
Predstojnik: prof. dr. Dimitrij Rupel - Katedra za teorijo prava in etiko v javnem življenju
Predstojnik: doc. dr. Vojko Strahovnik - Katedra za nacionalne in mednarodne varnostne študije
Predstojnik: doc. dr. Damir Črnčec
Katedre združujejo sorodne znanstveno-raziskovalne in pedagoške discipline, ki jih goji fakulteta, in skrbijo za njihov razvoj.